EncFS — свободное программное обеспечение, основанная на FUSE криптографическая файловая система, прозрачно шифрующая файлы, используя произвольную директорию в качестве места для хранения зашифрованных файлов.
Преимуществом encfs является то, что она работает как дополнительный слой над уже существующей файловой системой, а следовательно позволяет работать с отдельными файлами, без необходимости пересылать зашифрованный контейнер целиком.
Порт для Windows
Мобильные клиенты:
Клиент для Android
Аналоги:
Cryptomator
EncFSMP
Safe (GitHub) (Сайт программы)
BoxCryptor
Duplicati
Cloudfogger (Отзывы)
Статьи:
ru.Wikipedia
Обзор вариантов шифрования данных в облаках для Windows
Как зашифровать Ваши файлы и улучшить безопасность Dropbox
Сравнительное тестирование криптоконтейнеров и шифрованных файловых систем
Ещё ссылки:
EncFS Encrypted Filesystem
Linux man page
Google Code
Темы о шифровании на ru-board:
Лучшая программа для шифрования на лету - 2012-2015
Программы для шифрования информации