Union01 DCPlusPlus.xml - настройки (+косметические: а-ля размеры и положения столбцов в различных местах, ratio в About и т.п.)
Favorites.xml - избранные пользователи и хабы.
Queue.xml - Содержимое Download Queue, т.е. там хранятся запросы.
ADLSearch.xml - Не пользуюсь, потому у меня он пустой, а следовательно без понятия, что там может храниться.
files.xml.bz2 - файллист. Можно оставить или удалить - без разницы.
Во всяких модах есть еще xml'шки, типа, Recents (история посещения хабов что ли?), Profiles (видимо, профили; у меня пустой).
Если очень большой шаринг и он сильно не изменится после переустановки, то можно и HashData, HashIndex оставить. В принципе и все.
И еще, проще, конечно, забекапить всю папку.
PS: Для интересующихся более удобной системой игнорирования:
fulDC. Основан на DC++, пока еще интенсивно обновляется. Об игнорировании: создан раздел в меню. Постоянные игноры. Кроме полного nickname, можно пользовать wildcard и regexp. Для пользователей DC++ самое то. Пользователям StrongDC++ мода и его детей (LDC++, PeerWeb DC++ и т.п.), думаю, нет смысла пробовать.