» MMC

Как заставить работать программы(а в частности MS SQL Enterprise Manager.msc)у простых пользователей через групповую политику.
При запуске пишет, что GP не разрешает запускать ни *.msc Ни mmc.exe.

Смотри что у тебя выставлено в политиках "Конфигурация пользователя\Административные шаблоны\Компоненты Windows\Консоль управления Microsoft"

Просто эта оснастка не входит в стандартный набор
А на весь mmc я не хочу давать доступ

Можно создать оснастку для пользователя, включив в нее все что ты считаешь нужным.
PS Хорошие у тебя и грамотные пользователи...с MS SQL Enterprise

За комплимент в адресс пользователей спасибо - они грамотные,но не хорошие.
А как создать такую оснастку? И дать к ней доступ?

как созжать оснастку написано тут:
http://www.microsoft.com/technet/archive/ittasks/maintain/s2impgp.mspx