as2389  Цитата: он перестал воспринимать логин/пароль забитый в настройках
Цитата: Если сначала авторизоваться через on-line плагин, то потом открываются ярлыки созданные клиентом.
  Как-то нестыкуется, где забиты логин/пароль, кроме как не в онлайн-плагине?. 
 Вообще список действий примерно такой: 
 1. ставишь плагин с включенной опцией sson (или доставляешь соответствующую msi, если разобрал клиент на составляющие и поставил не все). 
 2. в настройках сайта агента в опциях авторизации разрешаешь passthrough и делаешь ее способом по умолчанию. 
 3. кладешь плагин в автозагрузку (если он сам туда по какой-то причине не попал). 
 В результате после входа в систему должны сразу обновиться ярлыки приложений и появится к ним доступ.   
 Возможно еще придется подкрутить политики безопасности на предмет EnableSSOnThruICAFile=On 
 SSOnUserSetting=On 
 которые раньше приходилось прописывать в конфиги клиента, а сейчас настраиваются политиками, но не в курсе, что там по умолчанию, т.к. не ставил.