Всё зависит от версии, установленной у вас.
Самый простой способ - сделать соответствующую задачу в KSC на удаление конкретной версии KES, задав пароль деинсталляции.
Для версии 10.2.1.23 код продукта 04CF7FBD-E56C-446D-8FC9-DD444BDBEE8E
10.2.2.10535, 10.2.4.674 - 7A4192A1-84C4-4E90-A31B-B4847CA8E23A
Ещё были 10.1.0.867
Попробуйте https://support.kaspersky.ru/common/service.aspx?el=1464 (хотя, эта утилита не для массового удаления, но как крайняя мера), и не забудьте задать пароль деинсталляции, если был задан.