На компе с Win7 существуют 3и (три) пользователя: 
 один с правами другие два обычные (бесправные хомки) 
   1. Ставлю MPC-BE под крутым султаном со всеми правами. 
 2. Настраиваю ассоциации файлов на ВСЕ поддерживаемые виды. 
 3. Захожу под другим именем (с ограниченными правами). 
 4. Вижу, что ассоциации в плеере установлены НЕ ВСЕ. 
 5. Нажимаю кнопку изменить. 
 6. Естественно, что система спрашивает пароль админа на доступ к изменениям ассоциаций. 
 7. Ввожу пароль и применяю настройки для ВСЕХ ассоциаций расширений файлов. 
 В итоге снова вижу, что применённые изменения не сработали. Так и остались не отмеченными некоторые расширения файлов для ассоциации с плеером. 
 Но, когда указываю выбрать программу для воспроизведения, то тогда ассоциации срабатывают и система запоминает.   
 Версия плеера - 1.4.6 (build 1196) beta