ukdouble1 тогда тебе надо оставить открытие файла и строки типа
VirtualDub.subset.Clear();
VirtualDub.subset.AddRange(229,20234);
VirtualDub.subset.AddRange(26417,23588);
VirtualDub.subset.AddRange(52773,13060);
VirtualDub.subset.AddRange(70136,57709);
VirtualDub.subset.AddRange(135746,41456);
VirtualDub.subset.AddRange(183576,15388);
или еще проще. Оставляешь ТОЛЬКО subset'ы, а все остальное стираешь. Сохраняешь в файл сценария, затем в дабе открываешь нужный файл (Ctrl-O) и следом - свой файл сценария (Ctrl-L).
Дальше настроишь кодеки и фильтры - и профит.
P.S.: ужасы SetCompData тебя не должны беспокоить. Это настройки кодека, которые ты видишь через окно конфигурирования.
Добавлено: Да, и точно - SetCompression и SetCompData можно переставить из аналогичного по техпараметрам файла с несжатым видео на выходе, если вдруг тебе не понравился предложенный вариант сделать все в GUI