Поскольку архитектура в CIS 6 претерпела изменения я это сделал так.
1. Сохранил файл конфигурации 5-й версии.
2. Установил 6-ку.
3. Открываю в текстовом редакторе файл COMODO - Proactive Security.cfgx (использую именно эту конфигурацию).
4. Открываю в текстовом редакторе файл ранее сохраненный файл конфигурации 5-й версии. Находиш в нем для фаервола <Firewall> и все что находится между тегами <PolicyItems></PolicyItems> переношу в фал конфигурации для 6-о версии. и так Далее <GlobalRules></GlobalRules> глобальные правила, <Predefined></Predefined> - предопределенные политики я их у себя не трогаю, <NetworkAliases></NetworkAliases> - Сетевые зоны, <PortAliases></PortAliases> - наборы портов.
Для <HIPS>тоже переношу <PolicyItems></PolicyItems>
5. Сохраняю конфигурационный файл для 6-ки, импортирую его и включить.